در سال 2004 یک تیم کانادایی با استفاده از دوربین 240 مگاپیکسلی، در مدت سه ساعت، 13 تصویر مختلف از تابلوی مونالیزا تهیه کرد. این تصاویر شامل تمام طیف فرکانسی از مادون قرمز تا ماوراء بنفش بوده است. تلاشی که چندین راز را بر ملا کرده است.
تصویر برداری سه بعدی  نشان داده است که سه طرح دیگر از مونالیزا در زیر نقاشی پنهان است! در طرح اولیه، لبخند او واضح تر بوده  و صد البته راز آلودگی فعلی را نداشته است. نکته دیگر اینکه مونالیزای اولیه، پیراهنی به تن داشته است که بیشتر مورد استفاده پرستاران و یا مادران قرار می گرفته است. این خود برای برخی، فرضیاتی به مانند اینکه شکل نشستن مونالیزا نشانه حاملگی اوست (1) ( چرا که بسیار شق و رق و بی  تکیه برصندلی نشسته ست) و یا اینکه  او همسر یک تاجر فلورانسی ست را تا حدودی تقویت می کند. از دیگر رازهای برملا شده این که مونالیزا در طرح های اولیه، موهای خود را از پشت  بسته بوده است. بایستی روشن نمایم  که موی رهای نقاشی فعلی، بسیار غیر معمول است، چرا که درآن زمان، تنها زنان بد کاره چنین می کرده اند! چیزی که پارادوکس های نقاشی را صد چندان می کند. نکته جالب دیگر این ست که ، در نقاشی هیچ اثری از قلم مو نیست و به ظاهر لئوناردو از انگشتان خود برای کشیدن اثر استفاده کرده است! همچنین در کنار چشمان و نیز لبان، ضخامت بیشتری از رنگ وجود دارد. داوینچی در حقیقت، از رنگینک های لعاب مانند و بسیار براقی استفاده کرده تا در اثر،  بازتاب های نور تشدید شده باشند. اما هنوز راز چگونگی به کار بستن این لایه ها روشن نشده است. این کشفها، میل به کمال و کار مدام داوینچی را روی آثارش، در زمان های مختلف نشان می دهد.

(1) فرضیاتی که در اطراف مونالیزا بوده است آن چنان دارای تنوع و متفاوت است که آدمی را شگفت زده می کند. برخی مونالیزا  را کر، برخی لال دانسته اند! برخی در او  فلجی در ناحیه دست تشخیص داده و برخی به دندان درد او اشاره کرده اند! شاید تنها فرض باقی مانده این بوده است که او حامله است!